El Aeropuerto de Boca Raton (BCT) es un aeropuerto de aviación en general ubicado inmediatamente adyacente a la Universidad de Florida Atlantic y la Carretera Interestatal 95. Tiene una torre de control. El Aeropuerto de Boca Raton es de propiedad pública y administrado por una autoridad de siete miembros, nombrados por la Comisión de la Ciudad de Boca Raton y el Condado de Palm Beach.
El Aeropuerto Internacional de Palm Beach (PBI) está ubicado en el norte de West Palm Beach.
El Aeropuerto Internacional de Fort Lauderdale-Hollywood (FLL) se ubica en el sur de Fort Lauderdale.

La U.S. Highway 1 pasa a través del centro de la ciudad, y los distritos industriales y comerciales.
La U.S. Highway 441 pasa a través de otros distritos comerciales y áreas rurales
La Interstate 95 bisecta la ciudad de norte a ciudad con 4 intercambios que llegan a Boca Raton.
El Turnpike de Florida pasa a través de zonas incorporadas de Boca Raton con una conexión a Glades Road (State Highway 808 o Autopista Estatal 808).

El sistema ferroviario Tri-Rail sirve a la ciudad con su estación Boca Raton ubicada en el lado sur de Yamato Road justo al oeste de la Interstate 95.
CSX Transportation y la Florida East Coast Railway (Ferrocarriles de la Costa Este de Florida) también sirven a la ciudad.